RCEP并非在真空中运行，它与亚太地区现有的数十个双边和多边FTA（如中国-东盟FTA、日越EPA、澳新FTA等）存在复杂的重叠和互动。企业面临一个“协定菜单”选择问题：同一笔贸易可能同时符合多个协定的原产地规则和降税安排，但每个协定的税率、原产地标准、手续复杂度各不相同。Pearl Gateway的研究发现，RCEP在某些产品上的税率并非最低，但它的优势在于覆盖范围最广，特别是对于涉及多个成员国原材料的复杂供应链，RCEP的区域累积规则可弥补双边FTA的不足。
叠加效应最典型的场景是“三角贸易”。例如，一家韩国公司生产汽车零部件，使用中国产的钢材和日本产的电子元件，最终出口到菲律宾。在RCEP下，只要区域价值成分达标，即可享受零关税；但如果选择中国-韩国FTA加韩国-菲律宾FTA的链式路径，则可能因无法累积日本材料而无法满足原产地要求。因此，RCEP实际上为那些供应链跨越三个以上成员国的企业提供了唯一的优惠通道。此外，RCEP中还有“更大范围的原产地声明的衔接条款”，允许企业在同一批货物中混合使用不同协定的原产地证书，只要在最终进口国统一申报。
对于企业而言，最务实的做法是建立“协定优选矩阵”。将所有相关FTA与RCEP并列对比，包括优惠税率、原产地规则（RVC门槛、CTC要求、累积规则）、海关程序便利度、以及日落条款。然后按产品、国别、时间段动态排序，选择最优者。Pearl Gateway建议企业定期（每季度或每半年）更新此矩阵，因为各协定税率在逐年变化，且RCEP的降税节奏与现有FTA可能存在差异。尤其需要警惕的是，若企业长期惯用旧FTA，可能错失RCEP带来的更高累积利益。因此，管理层应指派专人或委托专业机构，系统性审视整个进出口产品组合，确保每一次贸易都“选对协定”。这种精细化管理将成为RCEP时代企业竞争力的重要来源。